Santos FC tiene una sociedad con Associação Ponto Positivo, el equipo Santos Mobydix. Hay equipos masculinos y femeninos que compiten en competencias de 3×3 La iniciativa reúne a equipos masculinos y femeninos de baloncesto 3×3, equipos en silla de ruedas y equipos juveniles.

En 2021, se creó el proyecto de baloncesto de Santos FC, Santos FC Mobydix, con el objetivo de desarrollar el baloncesto en el Club. Inicialmente con equipos de baloncesto 3×3 masculino y femenino, el proyecto fue creciendo con el tiempo y, en menos de un año, ya cuenta con un equipo para usuarios de silla de ruedas, además de categorías básicas, donde los jóvenes se inician en este deporte. Detrás de escena, grandes nombres en el deporte ayudan a fortalecer y hacer crecer el proyecto.

Paulo Jamelli, ex futbolista que jugó en Peixe en 1995 y 1996, fue ejecutivo de fútbol del Club en 2009 y 2010, y actualmente se desempeña como empresario en el campo deportivo, es el director general de Santos FC Mobydix. Mientras que la medallista olímpica y campeona mundial de baloncesto femenino, Alessandra Santos, es la coordinadora del equipo.

Baloncesto 3×3
El baloncesto 3×3 es un segmento del deporte en crecimiento y con cada vez más practicantes. En esta modalidad, tres jugadores de cada equipo se enfrentan en media cancha, con el objetivo de llegar a 21 puntos o terminar adelante en el marcador para ganar el partido. Actualmente, los equipos 3×3 del Santos FC Mobydix están en el Campeonato Paulista de Basquete 3×3, además del Circuito Paulista de Baloncesto 3×3.

Equipo de silla de ruedas Históricamente reconocido por tener un gran brazo dedicado a las causas sociales, Santos FC presentó esta temporada su equipo de baloncesto en silla de ruedas en sociedad con el tradicional Ypiranga-SP. El equipo, brazo del proyecto Mobydix, es mixto y profesional y, con menos de cuatro meses de vida, ya sueña con títulos. En 2022, Santos FC Mobydix disputa la serie de plata del Campeonato Paulista y el Campeonato Brasileño de la categoría. El proyecto es innovador por ser el primer equipo de fútbol en tener un equipo de baloncesto para usuarios de silla de ruedas.

Divisiones Básicas Santos FC Mobydix ha ampliado cada vez más sus actividades en la modalidad y también pasó a trabajar en el desarrollo de las categorías básicas del baloncesto brasileño. El trabajo en la base surgió de una alianza con el proyecto Febre Baloncesto, desarrollado hace 13 años con jóvenes de entre 6 y 17 años, en la Baixada Santista. Actualmente, hay casi 200 atletas que reciben la oportunidad de practicar un deporte como una forma de desarrollo social y, para algunos, incluso de desarrollo profesional. Santos FC Mobydix cuenta actualmente con equipos de baloncesto 5×5 sub-14 y sub-16, que entrenan semanalmente en el Clube dos Ingleses, socio del proyecto, y compiten en el Campeonato Liga Santista, de la LBBS, filial de la Federación Paulista de Baloncesto.